资源
演示文稿和教程
这是Cajo ter Braak 于 2013 年 2 月 5 日在瓦赫宁根大学介绍 Canoco 5 时所做的演讲 (pdf) 的讲义。该演讲主要针对旧版 (4.0 和 4.5) CANOCO 的现有用户。新 Canoco 5 用户的讲义在此处。
演讲结束后,Cajo ter Braak 还利用这些材料提供了 45 分钟的动手教程。本教程参考了在计算机上安装 Canoco 5 后可用的数据。
视频教程
这些简短的视频将演示软件的使用,使用录制的屏幕操作并附有 Petr Šmilauer 的评论。
Canoco 5 新手之旅
文章
这些文章将更详细地阐明或描述有关 Canoco 5 中可用的统计或可视化方法的选定主题。
在Canoco 5安装文件夹的pdf子文件夹中,您可以找到两篇文章:
- terBraak_et_Smilauer_2015_Topics_constr_unconstr.pdf中的文章讨论了约束排序,同时也为单峰无约束方法中的去趋势进行了辩护
- terBraak_et_al_2017_dc-CA_preprint.pdf中的文章提供了有关 Canoco 5.10 中引入的 dc-CA 方法的基本信息。
错误和功能
要了解我们在最新发布的 Canoco 5 版本中发现的问题以及在之前的小版本中修复的问题的概述,请单击此处: Canoco 5 问题。如果您想报告列表中缺少的任何问题,请向我们发送消息。
手册勘误表
您可以在此处找到 5.1 和 5.0 手册版本的当前勘误表。Canoco 5.1 手册与 Canoco 5.0 手册的主要区别列在Canoco 安装文件夹 (通常是C:\Program Files\Canoco5文件夹) 的pdf\manual-changes.html 文件中。
推荐阅读
您的软件许可证附带的Canoco 5 手册是您开始的地方。我们建议您从第 1.1 节开始,阅读并练习第 2 章的内容(经验丰富的 Canoco 4.x 用户可以从第 2.9 节开始),然后阅读第 3 章的全部或选定部分。第 4、5 和 7 章具有参考性质,尽管它们也包含使用用户界面各个部分的介绍。阅读第 6 章的选定(或全部)部分可能会很有用,其中描述了可用的示例项目、围绕真实数据集的构建和研究问题。每个部分都由一个项目支持,其中已经存在所描述的分析和图表,以便您既可以检查所需的分析设置,也可以使用相同的数据进行自己的实验。要打开示例项目,请使用文件 | 打开项目菜单命令并在打开对话框的左侧找到Canoco 5 应用程序 | 示例快捷方式(在 Windows XP 下不存在,在更高版本的 Windows 中采用各种形式)。
Unimodal Models小册子包含许多介绍 Canoco 软件所基于的思想和方法的开创性论文。最初是 Cajo Ter Braak 的博士论文,后来又添加了他的论文。从 5.10 版开始,这本小册子以 pdf Unimodal_Models.pdf 的形式出现在Canoco/pdf 文件夹中。pdf 中的页码与 Canoco 5 手册中提到的一致。您还可以在 pdf 文件夹中找到论文“约束排序中的主题”( terBraak_et_Smilauer_2015_Topics_constr_unconstr.pdf ) 和关于双约束排序的论文预印本
( terBraak_et_al_2017_dc-CA_preprint.pdf )。
在有关多元分析主题且涵盖 Canoco 5 可用方法的众多出版书籍中,我们特别推荐两本:
对于那些需要轻松阅读的人,推荐剑桥大学出版社出版的P. Šmilauer & J. Lepš (2014) 使用Canoco 5 对生态数据进行多元分析。与第一版(2003 年出版)不同,这本书通过引用 Canoco 5 的示例来描述方法。
另一本用于排序(也用于分类、回归和空间分析)的入门手册是RHG Jongman、CJF Ter Braak 和 OFR Van Tongeren(1995 年)的《社区和景观生态学数据分析》,也可从剑桥大学出版社获得。1987 年版对大多数读者来说已经足够了,可从此处免费获得。
更难读的(字面意思)是P. Legendre & L. Legendre (2012) Numerical Ecology,由 Elsevier Press 出版。请注意出版年份,使用第三版对于一些较新的发展至关重要(例如包括空间信息的分析,例如在 Canoco 5 中也实现的 PCNM 方法)。
如果您有支持问题
如果您在安装 Canoco 5 软件时遇到问题,或者软件运行不符合文档中的预期,您有权获得免费支持。请联系软件经销商 (Microcomputer Power) 以获取此信息。如果他们无法妥善处理您的问题,他们会将其转交给软件作者。
对于与Canoco 5 相关的技术和统计问题,Canoco 5 的授权所有者可受邀加入基于订阅的网络讨论板,该讨论板由 Canoco 5(以及早期 4.x 版本)的共同作者 Petr Šmilauer 主持。
要加入该群组,请访问以下网页:
并点击页面左上角的[注册]链接,然后点击我同意按钮确认注册声明,然后在下一页填写所需的详细信息,随后点击页面底部的提交按钮确认。请确保您正确指定了软件经销商提供的许可证号(安装光盘信封或手册封面上提供的许可证号)。如果没有此号码,您的会员资格将不会被批准。
另一方面,您的生日信息来自平台本身,我们无法避免在表单中要求提供这些信息。我们建议您立即将其用途设置为“完全隐藏生日信息,不让公众查看”(在表单的下一行),这样管理员也看不到它(我们不关心您的年龄,也不会发送生日礼物 :-)。
一旦您提交页面,您的订阅请求将等待管理员(Petr Smilauer)的批准,他将在确认后通过个人欢迎电子邮件通知您,以便您知道您可以登录小组,阅读现有的支持问题及其答案,并最终提出您自己的问题。
ORDNEWS 邮件列表提供了有关排序方法和其他多元统计分析方法的通用列表。请参阅页面http://ordination.okstate.edu/ordnews.htm,了解有关如何订阅、如何发帖以及在列表通信中应做什么(不应做什么)的所有详细信息。
支持实用程序
要删除 Canoco 5 的用户帐户特定设置并将程序行为重置为安装后的状态,您可以下载并执行以下名为C5CleanReg的小实用程序。
这是一个可执行文件,您无需以任何特殊方式安装它,只需将其存储在任何文件夹中并从那里执行即可。请注意,要删除 Canoco 5 自定义设置,Canoco 5 在您执行此实用程序时不能运行。如果正在运行,C5CleanReg 会向您发出警告,并且直到您关闭 Canoco 5 应用程序后才会继续。